メソッドの引数にout/ref修飾子、ByRef修飾子が設定されている場合、引数は参照渡しとなり、メソッドは引数の値を別の値に置き換えることができます。　MethodInfo.Invokeメソッドを使ってメソッドを呼び出す場合、参照渡しによって置き換えられた値は引数parametersに渡した配列に格納されます。

MethodInfoでのメソッド呼び出しで参照渡しの引数を参照する
using System;
using System.Reflection;

class C {
  public void M(int x, ref int y)
  {
    Console.WriteLine("x = {0}", x);
    Console.WriteLine("y = {0}", y);

    x = 3; // 値渡し引数の値を変更する (呼び出し元には反映されない)
    y = 3; // 参照渡し引数の値を変更する (呼び出し元に反映される)
  }
}

class Sample {
  static void Main()
  {
    var t = typeof(C);

    var inst = Activator.CreateInstance(t);

    var m = t.GetMethod("M");

    // メソッド呼び出しに使用する引数の配列
    var args = new object[2] {42, 42};

    // メソッドを呼び出す(参照渡しとなる引数では、配列内の値が置き換えられる)
    m.Invoke(inst, args);

    // 置き換えられた値を参照する
    Console.WriteLine(args[0]);
    Console.WriteLine(args[1]);
  }
}
実行結果
x = 42
y = 42
42
3