ガベージコレクタの収集対象・マネージリソースは、.NETランタイム上で作成されるオブジェクト(=.NETランタイム内で確保され、.NETランタイムにより管理されるメモリ領域)に限られます。　一方、ファイルハンドルやソケットなどのOS資源は、(.NETランタイムではなく)OS側で管理されているものであるため、ガベージコレクタの収集対象外・アンマネージリソースとなります。　こういったアンマネージリソースを確保する場合は、確保した側が破棄・解放の責任を負います。

一例として、ファイルハンドルと、それを扱う操作を提供するFileStreamクラスの場合を見てみます。　FileStreamでは、インスタンスの作成時にその内部でファイルハンドルの取得が行われ、FileStreamのメソッドを呼び出すことによりそのファイルハンドルを経由したファイル操作が行われます。

FileStreamクラスによって保持されているファイルハンドルは、FileStreamクラスが破棄される時点でFileStreamクラス自身によって解放されます。　FileStreamクラスがファイルハンドルの確保から解放までの責任を負っているため、このクラスを使う側(および.NETランタイム)は直接ファイルハンドルの管理には関与しません。

using System;
using System.IO;

class Sample {
  static void Main()
  {
    // FileStreamでファイルを開く (FileStreamが、指定されたファイルのファイルハンドルを取得する)
    var stream = new FileStream("file.dat", FileMode.Open, FileAccess.Read, FileShare.Read);

    stream.ReadByte();
      :
      :

    // (ガベージコレクタによって)FileStreamが解放される時点で、FileStream自身がファイルハンドルの解放を行う
  }
}

別の例として、Marshal.Alloc*()等のメソッドでユーザーが独自に確保したメモリ領域も、アンマネージリソースとなります。　Marshal.Alloc*は.NETランタイムが管理するメモリ領域ではなく、(.NETランタイムではない何らかの)アロケータが管理するメモリ領域を取得するため、ガベージコレクタの収集対象外となります。　この場合、解放の責任を負うのはメソッドを呼び出したユーザー自身となるため、ユーザー自身がMarshal.Free*()等のメソッドで解放する必要があります。