単にジャグ配列内の各配列をソートしたい(各配列の位置は変えない)のであれば、次の例のように個々の配列に対してSortメソッドを呼び出すだけで出来ます。

ジャグ配列内の各配列をソートする
using System;

class Sample {
  static void Main()
  {
    var arr = new int[][] {
      new int[] {1, 2},
      new int[] {2, 1},
      new int[] {2, 1, 1},
      new int[] {1, 2, 2, 2},
      new int[] {1, 1},
      new int[] {1, 3},
      new int[] {1, 2, 3},
      new int[] {1, 2, 2},
      new int[] {2, 2},
      new int[] {2, 1, 1},
    };

    // ジャグ配列内の各配列をソート
    foreach (var subarr in arr) {
      Array.Sort(subarr);
    }

    for (var y = 0; y < arr.Length; y++) {
      for (var x = 0; x < arr[y].Length; x++) {
        Console.Write("{0}, ", arr[y][x]);
      }
      Console.WriteLine();
    }
  }
}
実行結果
1, 2, 
1, 2, 
1, 1, 2, 
1, 2, 2, 2, 
1, 1, 
1, 3, 
1, 2, 3, 
1, 2, 2, 
2, 2, 
1, 1, 2,