.NET Framework 4からは、バッファのクリアにStringBuilder.Clearメソッドを使うことが出来ます。 結果はLengthに0を指定した場合と同じです。

StringBuilder.Clearメソッドを使ってStringBuilderの内容をクリアする
Imports System
Imports System.Text

Class Sample
  Shared Sub Main()
    Dim sb As New StringBuilder("The quick brown fox jumps over the lazy dog")

    Console.WriteLine("<{0}> (Length={1})", sb, sb.Length)

    ' Clearメソッドでバッファをクリアする
    sb.Clear()

    Console.WriteLine("<{0}> (Length={1})", sb, sb.Length)

    ' 文字列を追加
    sb.Append("The quick brown fox")

    Console.WriteLine("<{0}> (Length={1})", sb, sb.Length)

    ' 長さを0にする (Clearメソッドと同じ操作となる)
    sb.Length = 0

    Console.WriteLine("<{0}> (Length={1})", sb, sb.Length)

    ' 文字列を追加
    sb.Append("The quick brown fox")

    Console.WriteLine("<{0}> (Length={1})", sb, sb.Length)
  End Sub
End Class
実行結果
<The quick brown fox jumps over the lazy dog> (Length=43)
<> (Length=0)
<The quick brown fox> (Length=19)
<> (Length=0)
<The quick brown fox> (Length=19)