Stringクラスと同様、文字列の挿入・削除・置換にはStringBuilder.InsertStringBuilder.RemoveStringBuilder.Replaceの各メソッドが使えます。 引数と動作はStringクラスのものとほぼ同じですが、InsertメソッドはAppendメソッド同様に文字列以外も追加出来ます。 なお、String.Removeメソッドとは異なり、StringBuilder.Removeメソッドでは削除する文字数を省略することは出来ません。

StringBuilder.Insert・Remove・Replaceメソッドを使って文字列を挿入・削除・置換する
using System;
using System.Text;

class Sample {
  static void Main()
  {
    var sb = new StringBuilder("The quick brown fox jumps over the lazy dog");

    Console.WriteLine("<{0}>", sb);

    // 4文字目から6文字分を削除
    sb.Remove(4, 6);

    Console.WriteLine("<{0}>", sb);

    // 29文字目から4文字分を削除
    sb.Remove(29, 4);

    Console.WriteLine("<{0}>", sb);

    // 29文字目に数値3を追加
    sb.Insert(29, 3);

    Console.WriteLine("<{0}>", sb);

    // 30文字目に" white "を追加
    sb.Insert(30, " white");

    Console.WriteLine("<{0}>", sb);

    // 文字列"dog"を"dogs"に置換
    sb.Replace("dog", "dogs");

    Console.WriteLine("<{0}>", sb);

    // 文字'o'を'a'に置換
    sb.Replace('o', 'a');

    Console.WriteLine("<{0}>", sb);

    // 文字列"brawn"をnullに置換(=削除)
    sb.Replace("brawn ", null);

    Console.WriteLine("<{0}>", sb);
  }
}
実行結果
<The quick brown fox jumps over the lazy dog>
<The brown fox jumps over the lazy dog>
<The brown fox jumps over the  dog>
<The brown fox jumps over the 3 dog>
<The brown fox jumps over the 3 white dog>
<The brown fox jumps over the 3 white dogs>
<The brawn fax jumps aver the 3 white dags>
<The fax jumps aver the 3 white dags>

StringBuilderの内容を完全に削除したい場合は、Clearメソッドを使うこともできます。